조직 샘플에서 곰팡이 DNA를 검출하고 식별하기 위한 팬 곰팡이 PCR 분석법의 개발 및 임상 적용

침습성 곰팡이 감염(IFIs)의 발생률 증가와 곰팡이 병원체의 범위 확대를 고려할 때, 원인 병원체의 조기 및 정확한 식별이 필수적이다. 우리는 배양에서 입증된(n=38) 또는 오직 조직학적으로 입증된(n=24) IFIs 환자들로부터 채취한 신선하고 포르말린 고정, 파라핀 매립(PE) 조직 샘플에서 곰팡이 DNA를 검출하기 위해 리보솜 DNA 유전자 군의 내부 전사 스페이서 1(ITS1) 영역을 표적으로 하는 팬 곰팡이 PCR 분석법을 개발하였다. PCR 산물은 시퀀싱 되었고 원인 병원체를 식별하기 위해 GenBank 데이터베이스의 시퀀스와 비교되었다. 분자 식별은 조직학적 검사 및 배양 결과와 상관관계가 있었다. 이 분석법은 각각 93.6% 및 64.3%의 배양에서 입증된 및 오직 조직학적으로 입증된 IFI 사례에서 곰팡이 병원체를 성공적으로 검출하고 식별하였다. Candida, Cryptococcus, Trichosporon, Aspergillus, Fusarium, Scedosporium, Exophiala, Exserohilum, Apophysomyces, Actinomucor, 및 Rhizopus와 같은 다양한 곰팡이 속이 식별되었다. 다섯 개의 샘플에서는 분자 분석이 배양에서 식별된 병원체와 밀접한 관련이 있는 병원체를 확인하였다. PCR 음성 샘플(n=10) 모두는 곰팡이 균사가 시각화된 PE 조직이었다. 결과는 조직 샘플에서 곰팡이를 정확하게 식별하기 위해 기존 실험실 테스트와 결합된 팬 곰팡이 PCR 분석법의 사용을 지지한다.