수로에서 분리된 Pectobacterium aquaticum sp. nov.

이 연구의 목표는 2015년과 2016년 남동부 프랑스의 세 가지 서로 다른 수로에서 분리된 여섯 개의 균주(A212-S19-A16T, A127-S21-F16, A105-S21-F16, A104-S21-F16, A101-S19-F16, A35-S23-M15)의 분류학적 지위를 수립하는 것이었습니다. gapA 가계 유전자 증폭 및 염기서열 분석을 통해 이 여섯 균주는 이미 설명되거나 제안된 Pectobacterium 종 및 아종 외부의 Pectobacterium 속 내부에 함께 군집화되었습니다. A212-S19-A16T, A105-S21-F16, A101-S19-F16 균주와 밀접하게 관련된 Pectobacterium polaris (CFBP 1403), Pectobacterium carotovorum subsp. odoriferum (CFBP 1878T), ‘Pectobacterium carotovorum subsp. actinidiae’ (CFBP 7370), Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum (CFBP 2046T), ‘Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense’ (CFBP 6617) 또는 가장 멀리 관련된 Pectobacterium aroidearum (CFBP 8168T)을 사용한 GENIII Biolog 플레이트를 이용한 표현형 분석에서 이 세 균주가 대사한 특정 화합물들을 규명하는 데 실패했으나, 이 세 균주에서 pH 5에서 약한 활성이 특이적으로 관찰되었습니다. 이 여섯 균주를 염기서열 분석하기 위해 Illumina 염기서열 분석이 사용되었습니다. 계통 발생 데이터, 평균 뉴클레오타이드 동질성 값 및 인 실리코 DNA–DNA 하이브리다이제이션 결과를 기반으로 하여 균주 A212-S19-A16T, A127-S21-F16, A105-S21-F16, A101-S19-F16, A35-S23-M15 및 A104-S21-F16이 Pectobacterium 속의 새로운 종을 나타내는 것으로 제안되며, 이 종의 이름으로 Pectobacterium aquaticum sp. nov.가 제안됩니다. 유형 균주는 A212-S19-A16T (=CFBP 8637T=NCPPB 4640T)입니다.