2-메틸-2,4-펜탄디올이 포도상구균 α-용혈소의 자발적인 조립을 7량체 구멍 구조로 유도한다.

포도상구균 α-용혈소는 수용성 단량체 단백질로 발현되며, 막 위에서 조립되어 7량체 구멍 구조를 형성한다. α-용혈소의 7량체 구멍 구조는 탈옥시콜레이트 세제 미셸, 인위적으로 구성된 인지질 이중층, 또는 적혈구가 존재할 때만 단량체에서 생체외에서 준비할 수 있다. 여기에서 우리는 세제를 사용하지 않고 2-메틸-2,4-펜탄디올(MPD)로 α-용혈소의 7량체 형태의 결정체를 준비하는 데 성공하였고, 그 구조를 결정하였다. 7량체 구멍의 구조는 이전에 보고된 것과 유사하였다. 이 구조에서 두 개의 MPD 분자가 Trp179 주위에 결합하였고, 그 주위에는 이전에 보고된 7량체 구멍 구조에 결합된 인지질 머리 그룹이 존재하였다. 크기 배제 크로마토그래피는 α-용혈소가 1년 동안 보관하더라도 자발적으로 조립되지 않았음을 보여주었다. SDS-PAGE 분석에서는 결정화 버퍼에 있는 화합물 중 MPD가 7량체 형성을 유도할 수 있다는 것을 밝혀냈다. 올리고머화를 가장 효율적으로 유도하는 MPD의 농도는 10%에서 30% 사이였다. 이러한 관찰에 근거하여, 우리는 MPD를 막 결합 없이 α-용혈소의 7량체 구멍 형성을 촉진할 수 있는 시약으로 제안한다.