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단일 세포 크로마틴 접근성 시퀀싱은 복잡한 조직의 후생유전적 이질성을 이해하는 데 강력한 기술이 되었습니다. 그러나 기존의 모든 실험 프로토콜을 사용하여 생성된 이러한 데이터의 포괄적인 처리, 분석 및 시각화를 위한 오픈 소스 소프트웨어가 부족합니다. 여기에서는 단일 세포 크로마틴 접근성 시퀀싱 데이터의 품질 평가, 분석 및 시각화를 위해 scATAC-pro를 제시합니다. scATAC-pro는 실험 프로토콜의 여러 주요 단계에 대해 다양한 품질 관리 지표를 계산하며, 유연한 방법 선택이 가능합니다. 품질 평가 및 하위 분석을 위한 요약 보고서를 생성합니다. scATAC-pro는 https://github.com/tanlabcode/scATAC-pro에서 사용할 수 있습니다.
Yu et al. (Mon,)은 이 질문을 연구했습니다.
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