돼지 로타바이러스의 혈청형 구별을 위한 전장 및 중합효소 연쇄 반응 유도 부분 길이 Gottfried 및 OSU 유전자 4 프로브의 특성 분석

돼지 로타바이러스의 VP4 (P 유형) 특이성을 결정하기 위해, 클론된 Gottfried 및 OSU 돼지 로타바이러스 유전자 4 cDNA에서 전장 및 부분 길이 유전자 4 프로브가 생산되었습니다. 프로토타입 Gottfried (VP7 혈청형 4) 및 OSU (VP7 혈청형 5) 돼지 로타바이러스 균주에서 유전자 4 세그먼트가 연구에 선택된 이유는 이들의 뚜렷한 P 유형과 유사한 혈청형을 가진 로타바이러스의 발생 때문입니다. 부분 길이 유전자 4 cDNA는 중합효소 연쇄 반응(PCR)에 의해 생산 및 증폭되었으며, 이는 유전자 세그먼트 4에 의해 암호화된 VP8의 가변 영역(nucleotides 211 to 612)의 일부를 포함합니다. 최적의 프로브 특이성과 민감성을 위해 필요한 혼합 조건은 이종 그룹 A 혈청형의 다양한 인간 및 동물 로타바이러스와 대표적인 그룹 B 및 C 돼지 로타바이러스에 대한 점 또는 노던(RNA) 블롯 혼합을 통해 결정되었습니다. PCR에서 유도된 유전자 4 프로브는 전장 유전자 4 프로브보다 더 특이성이 있었지만, 동등한 민감도를 보였습니다. Gottfried PCR에서 유도된 프로브는 Gottfried, SB2, SB3 및 SB5 G 혈청형 4 돼지 로타바이러스와 혼합하였습니다. OSU PCR에서 유도된 프로브는 OSU, EE, A580 및 SB-1A 돼지 로타바이러스 및 말 H1 로타바이러스와 혼합하였습니다. PCR에서 유도된 유전자 4 프로브와 선택된 돼지 로타바이러스 균주 간의 혼합 반응 결과는 이전의 혈청학적 또는 유전적 분석과 일치하여 진단 시약으로서의 적합성을 나타냅니다.