파르네실화된 펩타이드의 액체 크로마토그래픽 분석 및 질량 분석적 확인

파르네실화는 단백질의 C-말단에 15 탄소 단위를 후천적으로 붙이는 과정을 포함하여, 이를 통해 단백질이 세포막에 통합될 수 있도록 한다. 파르네실화 반응은 파르네실 그룹 기증체인 파르네실디포스페이트를 필요로 하며, 파르네실트랜스퍼레이즈에 의해 촉매 된다. 가장 잘 알려진 파르네실화된 단백질 중 일부는 종양 단백질로 잘 알려진 Ras 단백질 초가족에 속한다. Ras 단백질은 세포외 신호의 전달을 위해 막 내재화가 필요하므로, 파르네실트랜스퍼레이즈 억제제가 항암 화학요법제로 논의되고 있다. 이 후천적 변형의 중요성에도 불구하고, 파르네실화된 펩타드는 질량 분석과 결합한 고압 액체 크로마토그래피에 의해 드물게 연구되어 왔다. 본 연구에서는 다차원 단백질 확인 기술의 도움을 받아 파르네실화된 펩타이드의 액체 크로마토그래픽 분리를 조사하였다. 펩타드는 전기분무 이온화에 의해 추가적으로 이온화된 후, 이어서 탠덤 질량 분석을 통해 분석되었다. 우리는 파르네실화된 펩타이드가 비파르네실화된 펩타이드보다 역상에서 더 강하게 유지된다는 것을 입증하였다. 이를 통해 복잡한 펩타이드 샘플에 첨가되었을 때 파르네실화된 펩타지를 식별할 수 있었다. 어떤 경우에는 파르네실 그룹이 이온화 과정 중에 펩타이드로부터 분리된 것으로 보였으며, 탠덤 질량 스펙트럼은 종종 파르네실 부분의 중성 손실을 드러냈다.