نموذج بايزي عالي الأبعاد لاكتشاف الجينات الخاصة بالمرض في النسخ الجزيئي المكاني

يعد تحديد الجينات الدالة على المرض أمرًا حاسمًا لفهم آليات المرض وقد جذب اهتمامًا كبيرًا في البحث الطبي الحيوي. توفر النسخ الجزيئي المكاني رؤى غير مسبوقة لاكتشاف الجينات الخاصة بالمرض من خلال تمكين التباينات داخل الأنسجة. ومع ذلك، فإن هذه التكنولوجيا الجديدة تطرح تحديات أمام النماذج الإحصائية التقليدية التي تم تطويرها لتسلسل RNA، حيث غالبًا ما تتجاهل هذه النماذج التنظيم المكاني لنقاط الأنسجة. في هذه المقالة، نقترح نموذج انكماش بايزي لوصف العلاقة بين تعبيرات الجينات عالية الأبعاد وحالة المرض لكل نقطة نسيج، مع دمج الارتباط المكاني بين هذه النقاط من خلال المصطلحات الذاتية الانحدار. يتبنى نموذجنا هيكلًا هرميًا لتسهيل تحليل عينات متصلة متعددة ويتم توسيعه أيضًا لاستيعاب البيانات المفقودة داخل الأنسجة. لضمان ملاءمة النموذج لمجموعات بيانات بأحجام مختلفة، نقوم بتنفيذ إطارين حسابيين لتقدير المعلمات البايزية، مصممة لكل من السيناريوهات الصغيرة والكبيرة. يتم إجراء دراسات المحاكاة لتقييم أداء النموذج المقترح. يتم تطبيق النموذج المقترح لتحليل البيانات الناتجة عن دراسة سرطان الثدي إيجابي HER2.