Key points are not available for this paper at this time.
الملخص تعتبر مواقع الارتباط بعامل ربط CCCTC (CTCF) نقاط ساخنة لعدم استقرار الجينوم. على الرغم من ارتباط العديد من العوامل بهشاشة مواقع الارتباط ب CTCF، لم تدمج أي دراسة جميع العوامل المرتبطة بالهشاشة لفهم الآلية(ات) التي تعمل بها معًا. باستخدام نهج غير متحيز على مستوى الجينوم، وجدنا أن كسور الخيط المزدوج للحمض النووي (DSBs) تتزايد في مواقع الارتباط القوية، ولكن ليست الضعيفة، لـ CTCF في خمسة أنواع من الخلايا البشرية. تُعتبر الهياكل الثانوية البديلة للحمض النووي المواتية طاقيًا هي الأساس لمواقع الارتباط القوية لـ CTCF. تتوافق هذه الهياكل مع موقع مجمع قطع توبيزوميراز II (TOP2)، مما يشير إلى أن بنية الحمض النووي الثانوية تعمل كمتسلسلة تعرفية لارتباط TOP2 وقطعه عند مواقع ارتباط CTCF. علاوة على ذلك، فإن خفض مستوى CTCF زاد بشكل كبير من DSBs عند مواقع ارتباط CTCF القوية وعند مواقع CTCF الموجودة عند حدود المجالات المرتبطة طوبولوجيًا (TAD). عانت مواقع CTCF المرتبطة بحدود TAD التي فقدت CTCF عند خفض مستواه من زيادة DSBs عند مقارنتها بالمواقع المكتسبة، وتكون تلك المواقع المفقودة مفرطة التمثيل مع G-رباعيات، مما يشير إلى أن هذه الهياكل تعمل كعوازل حدودية في غياب CTCF، وتساهم في زيادة DSBs. هذه النتائج نمذجة كيف تسهل الهياكل الثانوية البديلة للحمض النووي تجنيد TOP2 إلى مواقع ارتباط CTCF، مما يوفر رؤى آلية حول هشاشة الحمض النووي عند مواقع ارتباط CTCF.
درس رايمر وزملاؤه (الخميس) هذا السؤال.