مواقع تنشيط عامل التنفس النووي 1 في الجينات التي تشفر الوحدة الغاما من ATP سينثاز، عامل البدء 2 ألفا، والنقل الأميني للتييروسين. التفاعل المحدد لعامل NRF-1 المنقى مع العديد من الجينات المستهدفة.

تم التعرف على عامل النسخ عامل التنفس النووي 1 (NRF-1) في الأصل كمُنشط لجين السيتوكروم ج وقد وُجد لاحقاً أنه يُحفز النسخ من خلال مواقع محددة في جينات نووية أخرى تعمل منتجاتها في الميتوكوندريا. تشمل هذه الجينات وحدات فرعية من مجمعات أكسيداز السيتيكروم والاختزال ومكونًا من الآلية المسؤولة عن تكرار الحمض النووي الميتوكوندري. هنا نُثبت أن موقع التعرف الوظيفي لـ NRF-1 موجود في جين وحدة الغاما من ATP سينثاز، مما يوسع الدور التنفسي المقترح لـ NRF-1 إلى المجمع الخامس. بالإضافة إلى ذلك، توجد مواقع نشطة بيولوجيًا لـ NRF-1 في الجينات التي تشفر وحدة البدء 2 ألفا من البروتينات حقيقية النواة والنقل الأميني للتييروسين، وكلاهما يشارك في الخطوة المحددة للسرعة في مسارات تخليق البروتينات وتحلل التييروسين الخاصة بهم. تشكل مواقع التعرف من كل من هذه الجينات مجمعات متطابقة مع NRF-1 كما تم إثباته من خلال اختبارات ربط المنافسة، وتقنيات التشويش بالميثيل، والتشبيك الناتج عن الأشعة فوق البنفسجية للحمض النووي. كما تحفز أوليغومرات المستنسخة من كل موقع ربط لـ NRF-1 نشاط مروج تقصير السيتوكروم ج في الخلايا المُدخلة. كانت أنشطة ربط NRF-1 للمواقع المستهدفة المختلفة مُترافقة بحوالي 33,000 ضعف وكانت موجودة في بروتين واحد وزنه 68 كيلو دالتون. تدعم هذه الملاحظات دور NRF-1 في التعبير عن الجينات التنفسية النووية وتقترح أنه قد يساعد في تنسيق الأيض التنفسي مع مسارات حيوية تخليقية وتفككية أخرى.