Key points are not available for this paper at this time.
تزايد الطلب على طرق أسرع وأكثر دقة لتحليل المجتمعات الميكروبية من العينات الطبيعية والسريرية في صناعة الطب والرعاية الصحية. لقد سهلت التطورات الأخيرة في تقنيات تسلسل الجيل التالي توضيح تكوين المجتمعات الميكروبية بدقة أعلى وإنتاجية أكبر مما كان ممكنًا سابقًا؛ ومع ذلك، غالبًا ما تحدد قراءات التسلسل القصيرة تحليل التركيب الميكروبي على مستوى الأنواع بسبب التشابه العالي في تسلسلات الأمبليكون 16S rRNA. للتغلب على هذه القيود، استخدمنا منصة تسلسل النانو لقراءة مكتبات الأمبليكون الكامل لطول 16S rRNA المجهزة من ميكروبات أمعاء الفئران. أظهرت المقارنة بين بيانات تسلسل النانو وبيانات القراءة القصيرة أنه لم يكن هناك اختلافات كبيرة في الوحدات التصنيفية الرئيسية (89%) باستثناء نوع واحد وثلاث وحدات تصنيفية. علاوة على ذلك، كانت بيانات التسلسل متشابهة للغاية في جميع المستويات التصنيفية باستثناء مستوى الأنواع. على مستوى الأنواع، سمح تسلسل النانو بتحديد المزيد من الأنواع مقارنة بتسلسل القراءة القصيرة، مما يسهل التصنيف الدقيق لتكوين المجتمع البكتيري. لذلك، ستكون هذه الطريقة لتسلسل الأمبليكون الكامل لطول 16S rRNA مفيدة للكشف السريع والدقيق والفعال عن التنوع الميكروبي في عينات بيولوجية وسريرية مختلفة.
دراسة شين وآخرون (الخميس) في هذا السؤال.