Key points are not available for this paper at this time.
تحليل الحمض النووي المباشر هو الأسلوب الأكثر استخدامًا لتوصيف الكائنات الدقيقة في البيئات الطبيعية والمبنية؛ لذلك، هناك حاجة إلى طرق موثوقة وفعالة لاستخراج الأحماض النووية من عينات الأنواع البيئية المحددة. في هذه الدراسة، قمنا بمقارنة ثلاث مجموعات تجارية لاستخراج الحمض النووي الميتاجينومي من ثلاثة أنواع من الكتلة الحيوية: الطين المنشط، والبيوفيلم، والمواد الناتجة عن التحلل اللاهوائي. تم قياس العائد، والنقاء، وجودة الحمض النووي، وتم تقييم التأثير الذي أحدثته مجموعة الحمض النووي على تحليل المجتمع الميكروبي التالي من خلال تحليل الفجوات بين المورثات في الريبوسومات (ARISA). تم تحليل الأمبليكون تلقائيًا باستخدام الرحلان الكهربائي الشعري. بالنسبة للطين المنشط والمواد الناتجة عن التحلل، فإن المجموعة المقترحة هي مجموعة FastDNA™ Spin Kit for Soil (MP Biomedicals). سمحت هذه المجموعة بالحصول على أعلى عائد من الحمض النووي وقدمت أعلى تنوع بيولوجي. بالنسبة للبيوفيلم ذو المحتوى العالي من المواد البوليمرية الخارجية، يُوصى باستخدام مجموعة FavorPrep™ Soil DNA Isolation Mini Kit (FAVORGEN). سمحت هذه المجموعة بالحصول على أعلى تنوع بيولوجي وقدمت النتائج الأكثر موثوقية لتقييم المسافة الجينية في هذا النوع من الكتلة الحيوية.
درس فلورزيك وآخرون (الخميس،) هذه المسألة.