Key points are not available for this paper at this time.
نماذج الفئران المتشابهة جينياً هي أورام مشتقة من خلايا السرطان الفأرية المزروعة على سلالات فئران متطابقة جينياً. تُستخدم هذه النماذج على نطاق واسع كأدوات لدراسة مناعة الورم واستجابة العلاج المناعي في سياق نظام مناعي فأري وظيفي بالكامل. تم إنشاء كميات كبيرة من ملفات تعبير الأورام في الفئران المتشابهة جينياً تحت علاجات مختلفة للعلاج المناعي، على الرغم من أن عدم وجود جمع وتحليل منهجي يجعل إعادة استخدام البيانات تحديًا. نقدم Tumor Immune Syngeneic MOuse (TISMO)، وهي قاعدة بيانات تحتوي على مجموعة شاملة من ملفات نماذج الفئران المتشابهة جينياً مع ميزات تصور تفاعلية. تحتوي TISMO على 605 عينة RNA-seq في المختبر من 49 سلالة خلايا سرطانية متشابهة جينياً عبر 23 نوع من السرطان، منها 195 خضعت لعلاج السايتوكين. تشمل TISMO أيضًا 1518 عينة RNA-seq في الجسم الحي من 68 نموذج ورم فأري متشابه جينياً عبر 19 نوع من السرطان، منها 832 من دراسات حجب نقاط التفتيش المناعية (ICB). قمنا بتعليق بيانات العينة يدوياً، مثل سلالة الخلايا، سلالة الفأر، موقع الزرع، العلاج، وحالة الاستجابة، ونعالج بيانات RNA-seq بشكل موحد ونتحقق من جودتها. بالإضافة إلى تحميل البيانات، توفر TISMO واجهات ويب تفاعلية للتحقق مما إذا كانت التعبيرات الجينية المحددة، أو إثراء المسارات، أو مستوى تدفق المناعة مرتبطًا باستجابة العلاج المناعي المختلف. TISMO متاحة على http://tismo.cistrome.org.
درس زينغ وآخرون (الخميس) هذا السؤال.