삼뉴클레오타이드 이인산 dApdApdA 및 핵자기공명 및 원형 이양 연구에서 그 구성 요소의 구조적 특성

360 MHz에서의 프로톤 NMR 연구는 삼뉴클레오타이드 이인산 dApdApdA, 이뉴클레오타이드 일인산 dApdA 및 모노머 pdA, pdAp와 dAp의 메틸포스페이트 에스터에 대해 수행되었다. 또한, 다양한 온도에서 원형 이양을 통해 화합물들이 연구되었다. 전체 NMR 스펙트럼 분할이 제공된다. 원형 이양 스펙트럼에서 얻은 스태킹의 열역학을 사용하여 다양한 온도에서 측정된 커플링 상수를 순수한 스택 상태에 적합한 값으로 외삽하였다. 데이터는 Altona, C. 및 Sundaralingam, M. (1972) J. Am. Chem. Soc. 94, 8205--8212에 따라 N 및 S 디옥시리보스 유사 회전 범위 측면에서 해석되었으며, 트리머의 오른쪽 나선형이 두 가지 뚜렷한 형태로 존재한다는 것이 밝혀졌다: 주요 형태는 B-DNA 유사 구조 S-S-S에 해당하며, 소수 형태(30%)는 설탕 고리가 지금까지 의심되지 않았던 S-S-N 구조 순서를 갖고 있다. 이인산은 매우 유사하게 행동하며, 70% S-S 및 30% S-N 스택의 혼합을 나타낸다. S형 설탕 고리의 상세한 기하학은 불변이 아니며, 주어진 뉴클레오타이드 단위 위에 다른 염기가 쌓일 때 약간의 변화가 나타나는 것으로 보인다. 용액에서 완전 스택된 B-DNA 유사 단일 나선의 주축 각도는 (P에서 시작하는 표기법) 베타 = 187도, 감마 = 50도, 델타 = 138도, 엡실론 = 186도이다.