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종양 세포주는 메틸화 결함을 평가하도록 설계된 연구를 포함하여 대장암(CRC) 연구에서 일반적으로 사용됩니다. CRC 세포주에서 알려진 많은 유전적 변이는 포괄적으로 설명되었지만, 그들의 메틸화 상태에 대한 연구는 수행되지 않았습니다. 이 연구에서는 30개의 일반적으로 사용되는 CRC 세포주와 유전성 비용양성 대장암(HNPCC) 환자에서 얻은 7개의 원발 종양을 평가하여 대장암에서 하이퍼메틸화된 것으로 알려진 6개의 CpG 섬인 hMLH1, p16, 종양 내 메틸화(MINT-) 1, 2, 12 및 31의 메틸화를 조사하였습니다. 세포주는 또한 마이크로위성 불안정성(MSI), 유전체 상태, hMLH1 발현 및 APC 및 Ki-ras의 돌연변이에 대해 평가되었습니다. 메틸화는 대부분의 세포주에서 조사된 모든 위치에서 자주 관찰되었으며, 생식계 유래 세포주와 산발적인 세포주 간에는 차이가 관찰되지 않았습니다. MINT 1에서 63%, MINT 2에서 57%, MINT 12에서 71%, MINT 31에서 53%, p16에서 71%, hMLH1에서 30%의 세포주에서 메틸화가 발견되었습니다. 전체적으로 단 하나의 세포주, SW1417만이 어떤 위치에서 메틸화를 보이지 않았습니다. 메틸화는 MSI 및 염색체가 불안정한 세포주에서 동일한 빈도로 발견되었습니다. MSI는 산발적인 CRC에 비해 세포주에서 과도하게 표현되었으며, 세포주의 47%에서 검출되었습니다. 코돈 13 Ki-ras 돌연변이의 비율은 또한 생체 내 연구에서 예상되는 것보다 3배 이상 높았습니다. 우리는 CpG 섬 하이퍼메틸화가 생체 내에서든 배양에서든 CRC 세포주에서 보편적인 현상이라는 결론을 내립니다. 우리는 CRC 세포주가 실제 종양의 작은 하위 집합만을 대표할 수 있다고 제안하며, 이는 CRC 세포주를 에피제네틱 연구에 사용할 때 고려해야 할 사항입니다.
Suter et al. (Sat,)은 이 질문에 대해 연구하였습니다.