ProFound: Um Sistema Especializado para Identificação de Proteínas Usando Informações de Mapeamento de Peptídeos por Espectrometria de Massa

Descrevemos o motor de busca de proteínas "ProFound", que emprega um algoritmo bayesiano para identificar proteínas a partir de bancos de dados de proteínas usando dados de mapeamento de peptídeos por espectrometria de massa. O algoritmo classifica os candidatos a proteínas levando em conta propriedades individuais de cada proteína no banco de dados, bem como outras informações relevantes para o experimento de mapeamento de peptídeos. O programa identifica consistentemente a(s) proteína(s) correta(s), mesmo quando a qualidade dos dados é relativamente baixa ou quando a amostra consiste em uma mistura simples de proteínas. Exemplos ilustrativos de identificações de proteínas são fornecidos.