아연 손가락 단백질 결합에 의한 DNA 풀림

Cys2His2 유형의 아연 손가락 도메인은 많은 수의 진핵세포 단백질에서 발견됩니다. 이러한 도메인을 포함하는 다양한 단백질들이 DNA, RNA 및 DNA-RNA 하이브리드에 특이적으로 결합하는 것으로 나타났습니다. 아연 손가락 단백질-DNA 복합체의 구조적 연구는 DNA 분자가 기준 B형에 비해 풀린 상태에 있음을 밝혔습니다. 아연 손가락 단백질이 DNA의 기존 풀린 형태를 인식하는지 아니면 결합 시 그런 형태를 유도하는지는 명확하지 않았습니다. 우리는 Sp1과 몇 가지 설계된 아연 손가락 단백질의 DNA 결합 도메인이 결합 시 DNA를 풀림을 보고합니다. 풀림 정도는 아연 손가락 단백질-DNA 코크리스탈 구조에서 관찰된 것과 일치합니다. 이러한 DNA 변형은 전체 결합 친화성을 결정하는 데 중요할 수 있으며, 결합 부위 선호에 영향을 미칠 수 있습니다. 게다가 아연 손가락 단백질 결합 시 DNA 형태의 변화는 전사 조절 및 아연 손가락 단백질의 다른 활동에 중요한 단백질-단백질 상호작용에 영향을 줄 수 있습니다.