사분형 이온 트랩 질량 분석법에 의한 개선된 인산펩타이드 서열 분석을 위한 중성 손실 활성화 방법

질량 분석 이전의 인산펩타이드 농축에서 최근의 발전은 인산단백질체 특성화에 대한 진정한 가능성을 보여줍니다. 충돌 활성화 분해(CAD)를 사용한 인산펩타이드 이온의 연속 질량 분석은 종종 인산의 중성 손실에 의해 지배되는 생성 이온을 생성합니다. 여기에서는 사분형 이온 트랩 질량 분석기에서 인산펩타이드 이온 분해를 위한 새로운 방법인 Pseudo MS(n)를 설명합니다. 이 방법은 전구체 이온의 활성화 후 인산의 중성 손실로 인해 발생하는 생성 이온의 충돌 활성화를 유도합니다. 따라서 주요 중성 손실 생성 이온은 다양한 구조적으로 유익한 종으로 전환됩니다. 원래의 전구체 활성화와 이후의 모든 중성 손실 생성 활성화에서 생성된 이온이 동시에 저장되므로 이 방법은 여러 전구체에서 파생된 조각을 포함하는 '복합' 스펙트럼을 생성합니다. 기존 MS/MS(CAD)에 의한 분석과 비교할 때, Pseudo MS(n)는 10개의 합성 인산펩타이드 중 7개에서 인산펩타이드 이온 분해가 개선되었음을 자동 검색 알고리즘(TurboSEQUEST)에 의해 판단하였습니다. 단일 인산단백질의 효소 분해에 의해 생성된 펩타이드에 Pseudo MS(n)를 적용했을 때도 비슷한 전반적인 개선이 관찰되었습니다. 마지막으로, 복잡한 인산펩타이드 혼합물에 적용했을 때, 기존 CAD 접근법 하에서 TurboSEQUEST에 의해 잘못 할당된 여러 인산펩타이드가 Pseudo MS(n)에 의한 분석 후 성공적으로 확인되었습니다.