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O estudo da expressão gênica em mamíferos através do uso de ensaios de transfecção transitória ampliou significativamente nosso conhecimento sobre os mecanismos transcricionais. No entanto, os construtos de promotores transfectados nem sempre servem como "substitutos" apropriados para genes endógenos, especialmente em casos onde a remodelação da cromatina deve ocorrer. Os exemplos descritos acima indicam que um nível de cautela é aconselhável ao estudar a regulação de vários promotores e a função de fatores de transcrição com o uso de ensaios de transfecção transitória. Quando possível, a função dos promotores endógenos correspondentes deve ser testada para avaliar a validade dos mecanismos regulatórios definidos em templates transfectados transitórios e não replicantes. Estudos futuros utilizando comparação de templates como ferramenta sem dúvida identificarão quais fatores de transcrição são críticos para iniciar mudanças essenciais na estrutura da cromatina em genes-alvo endógenos e ajudarão na elucidação dos mecanismos envolvidos nas transições da cromatina. Assim como nos experimentos com MyoD (36Gerber A.N. Klesert T.R. Bergstrom D.A. Tapscott S.J. Genes Dev. 1997; 11: 436-450Crossref PubMed Scopus (233) Google Scholar), estes estudos também permitirão a identificação de domínios funcionais nesses fatores, que são necessários para a remodelação da cromatina. Diferenças funcionais entre templates transfectados transitórios e estáveis replicantes não precisam ser consideradas artifatuais, mas podem ser exploradas para identificar e caracterizar mecanismos regulatórios que envolvem componentes da cromatina. A compreensão total da expressão gênica in vivo não será alcançada até que esses mecanismos sejam compreendidos em detalhe.
Smith et al. (1997) estudaram essa questão.
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