सूक्ष्मजीव समुदायों का वर्णन करने के लिए फैटी एसिड मिथाइल एस्टर (FAME) विधियों की तुलना

फैटी एसिड प्रोफाइलिंग प्राकृतिक प्रणालियों के सूक्ष्मजीव समुदायों का वर्णन करने के लिए एक लोकप्रिय विधि है। सूक्ष्मजीव फैटी एसिड का प्रत्यक्ष निष्कर्षण इन सिचु से उन विधियों की तुलना में उपयोगी होगा जो पहले लिपिड निकालते हैं और उसके बाद लिपिड से फैटी एसिड मुक्त करते हैं। इस अध्ययन में, चार अलग-अलग तरीकों से मिट्टी से फैटी एसिड के प्रत्यक्ष निष्कर्षण के लिए दो विधियों की तुलना की गई। ताजा मिट्टी की फैटी एसिड मिथाइल एस्टर (FAME) प्रोफाइल का विश्लेषण एक एस्टर-लिंकेड (EL) विधि और MIDI (Microbial ID, Inc., Newark, DE) के विधि द्वारा किया गया। मिट्टी को चार अलग-अलग तरीकों से संग्रहीत किया गया (4°C पर नम, -20°C पर नम, 25°C पर हवा में सुखाए गए, और 4°C पर आंशिक रूप से सुखाए गए) और 30 और 90 दिन के संग्रहण के बाद FAME प्रोफाइल परिवर्तनों के लिए विश्लेषण किया गया। EL और MIDI विधि के लिए क्रमशः ग्यारह और 17 FAME विशिष्ट थे, लेकिन विशेष FAME आमतौर पर केवल छोटे मात्रा में पाए गए। MIDI विधि से निकाली गई मिट्टियों में अधिक हाइड्रॉक्सी FAME और छोटे-श्रृंखला संतृक्त और शाखित FAME पाए गए। इसके विपरीत, EL-निकाली गई मिट्टियों ने आम तौर पर अधिक लंबे-श्रृंखला संतृक्त और शाखित FAME, असंतृक्त FAME, और साइक्लोप्रोपेन और मिथाइल समूहों वाले FAME उत्पन्न किए। दोनों निष्कर्षण विधियाँ अलग-अलग मिट्टी के प्रकारों के समुदायों के बीच भेदभाव करने में सक्षम थीं, चाहे मिट्टियाँ ताजा हों या संग्रहीत। संग्रहीत मिट्टियों में FAME प्रोफाइल परिवर्तन हुए, लेकिन समय के साथ FAME पैटर्न को संरक्षित करने के लिए प्रत्येक संग्रहण प्रोटोकॉल की प्रभावशीलता चार मिट्टियों के बीच भिन्न थी। जबकि सामुदायिक विश्लेषण ताजा मिट्टी पर किए जाने चाहिए, संग्रहण के समग्र प्रभाव निष्कर्षण विधि और मिट्टी के प्रकार की तुलना में थोड़े थे।