Didymellaceae의 하이라이트: Phoma 및 관련 pleosporalean 속을 특성화하기 위한 다면적 접근

곰팡이 분류학자들은 다형성과 유형의 불명확한 종 경계로 인해 무성 곰팡이 종을 다룰 때 지속적으로 문제에 직면합니다. 이러한 문제는 Phoma 속에서 잘 나타납니다. 이 식물병리학적으로 중요한 곰팡이 속은 현재 단일 또는 몇 개의 형태적 특성에 기반하여 아홉 개의 섹션으로 세분화되어 있습니다. 그러나 이러한 세분화는 여러 섹션 전용 특성이 단일 종 내에서 발생할 수 있기 때문에 모호합니다. 또한 많은 접합체 속이 Phoma와 관련되어 있으며, 그 중 세 가지가 여기에서 인정됩니다. 이 연구에서는 다중 염기 서열 타이핑을 통해 보다 진화론적으로 더 올바른 속의 경계를 설정하는 것을 시도합니다. 따라서 28S nrDNA (대소단위 - LSU), 18S nrDNA (소단위 - SSU), 내부 전사 스페이서 영역 1 & 2 및 5.8S nrDNA (ITS), 및 베타-튜불린 (TUB) 유전자 영역의 일부에서 얻은 서열을 활용하여 다수의 분석이 수행되었습니다. 총 324개의 균주가 분석에 포함되었으며 이 중 대부분은 Phoma 속에 속하고, 54개는 관련 pleosporalean 곰팡이에 해당합니다. 총 206개의 분류가 조사되었으며 그 중 159개는 Phoma와의 친연성이 알려져 있습니다. 계통 분석에 따르면 현재 Boeremaean 세분화는 진화론적으로 부정확하며, 이 속이 매우 다계통적임을 드러냅니다. Phoma 종은 Pleosporales 내에서 여섯 개의 뚜렷한 클레이드에 회수되며, 서로 다른 과에 속하는 것으로 보입니다. 그러나 대부분의 종은 이 식물군의 유형을 포함하여 최근에 설립된 과인 Didymellaceae에 군집화되었습니다. 이 연구의 두 번째 부분에서, 이 클레이드의 종과 변종의 계통적 변이를 추가로 평가하였습니다. Didymella 속을 제외하고, Phoma s. str.의 유일한 접합체로 간주되는 우리는 또한 이 클레이드에서 Leptosphaerulina 및 Macroventuria 속에 속하는 분류도 회수하였습니다. 얻은 서열 데이터를 기반으로, Didymellaceae는 최소 18개의 독특한 클러스터로 분리되며, 이 중 많은 수가 여러 특정 분류학적 특성과 연관될 수 있습니다. 이 클러스터 중 네 개는 계통과 형태학에 의해 충분히 정의되어, 관련된 분류가 별개의 속으로 옮겨질 수 있었습니다. 추가로, 이 연구는 과학에 새롭게 등장한 여덟 종과 두 변종의 분류학적 설명 및 61개의 추가 분류의 재조합을 다루고 있습니다.