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MOTIVAÇÃO: Geração de ferramentas rápidas de clustering hierárquico para serem aplicadas quando as distâncias entre elementos de um conjunto são restritas, causando empates frequentes de distância, como ocorre em dados de interação de proteínas. RESULTADOS: Apresentamos neste trabalho o programa UVCLUSTER, que explora iterativamente conjuntos de dados de distância usando clustering hierárquico. Assim que o usuário seleciona um grupo de proteínas, o UVCLUSTER converte o conjunto de distâncias primárias entre elas (ou seja, o número mínimo de passos, ou interações, necessários para conectar duas proteínas) em distâncias secundárias que medem a força da conexão entre cada par de proteínas considerando as interações para todas as proteínas do grupo. Mostramos que essa nova estratégia tem vantagens sobre métodos convencionais de clustering para explorar dados de interação proteína-proteína. O UVCLUSTER facilmente incorpora a informação dos maiores conjuntos de dados de interação disponíveis para gerar tabelas abrangentes de distâncias primárias. A versatilidade, simplicidade de uso e alta velocidade do UVCLUSTER em computadores pessoais padrão sugerem que ele pode ser uma ferramenta analítica de referência para análise de dados de interatômica. DISPONIBILIDADE: O programa está disponível mediante solicitação dos autores, gratuito para usuários acadêmicos. Informações adicionais disponíveis em http://www.uv.es/genomica/UVCLUSTER.
Arnau et al. (Qui,) estudaram esta questão.