서열 오류가 있는 샘플에서 중립성 테스트

인구 유전학에 사용될 수 있는 많은 데이터 세트는 인위적인 위치, 즉 서열 오류를 포함하고 있습니다. 여기에서 우리는 우선 이러한 오류가 몇 가지 일반적인 요약 통계에 미치는 영향을 탐구하며, 서열 오류가 주로 단일체라고 가정합니다. 따라서 이러한 오류가 존재할 경우 추정치가 강한 편향을 받을 수 있음을 보여줍니다. 우리는 또한 서열 오류의 수가 보통 수준일 때에도 주파수 스펙트럼에 기반한 중립성 테스트가 중립성을 거부한다는 것을 보여줍니다. 이는 그러한 오류가 있는 데이터 세트에 대한 분석이 진화 시나리오에 대한 잘못된 추론으로 이어진다는 것을 의미합니다. 이러한 오류를 피하기 위해 우리는 단일체를 무시하는 두 가지 새로운 세타 추정량과 서열 오류에도 불구하고 중립성을 테스트하는 데 사용할 수 있는 두 가지 새로운 테스트 Y와 Y*를 제안합니다. 전체적으로 우리는 단일체를 무시하더라도 이러한 새로운 테스트가 표준 중립 모델로부터의 편차를 감지하는 데 어느 정도의 힘을 보여준다는 것을 보여줍니다. 따라서 우리는 의심스러운 데이터 세트에서 결론을 강화하기 위해 이러한 새로운 테스트의 사용을 권장합니다.