EzTaxon: una herramienta basada en la web para la identificación de procariotas basada en secuencias de genes de ARN ribosómico 16S

Las secuencias del gen del ARN ribosómico 16S se han utilizado ampliamente para la identificación de procariotas. Sin embargo, la avalancha de secuencias de cepas no tipo y la falta de una base de datos revisada por pares para las secuencias de gen de ARN ribosómico 16S de cepas tipo han dificultado la identificación rutinaria de aislados, haciéndola laboriosa. En el presente estudio, generamos una base de datos que contiene las secuencias de gen de ARN ribosómico 16S de todas las cepas tipo procariotas. Además, se construyó una herramienta basada en la web, llamada EzTaxon, para el análisis de secuencias de gen de ARN ribosómico 16S con el fin de lograr la identificación de aislados basada en valores de similitud de nucleótidos por pares y métodos de inferencia filogenética. El sistema desarrollado proporciona a los usuarios una búsqueda basada en similitudes, alineación de múltiples secuencias y varios análisis filogenéticos. Todas estas funciones, junto con la base de datos de secuencias de gen de ARN ribosómico 16S de cepas tipo, pueden ser utilizadas con éxito para la identificación automatizada y confiable de aislados procariotas. El servidor EzTaxon es accesible gratuitamente a través de Internet en http://www.eztaxon.org/