SMART領域ベースの配列アノテーションリソースの最近の改善

SMART（Simple Modular Architecture Research Tool, http://smart.embl-heidelberg.de）は、タンパク質ドメインのアノテーションとドメインアーキテクチャの分析に使用されるウェブベースのリソースで、特に移動性真核ドメインに重点を置いています。各ドメインファミリーに関する機能、細胞内局在、系統分布、三次構造に関連する情報を提供する広範なアノテーションが利用可能です。2002年1月のリリースでは、200以上の手作業でキュレーションされたドメインモデルが追加され、これにより、核、シグナル伝達、細胞外タンパク質の間で広く表現されている600以上のドメインファミリーに達しました。アノテーションには、特定のドメイン内の1つ以上の変異に関連する人間の病気がある場合、オンラインメンデル遺伝病（OMIM）データベースへのリンクも含まれています。新しい分析方法が実装され、他の方法も更新されました。新しい高度なクエリは、SQLを使用してSMARTリレーショナルデータベースへの直接アクセスを提供します。このデータベースは、膜貫通領域、コイルコイル、シグナルペプチド、内部リピートなどの内因性配列特徴に関する情報を含むようになりました。SMARTの出力は、ユーザーのドキュメントに簡単に含めることができるようになりました。SMARTミラーは、http://smart.ox.ac.ukに作成されました。