OncoKB: Eine Wissensdatenbank für präzisionsorientierte Onkologie

Zielsetzung Mit der Etablierung der prospektiven klinischen Sequenzierung von Tumoren als wesentlicher Bestandteil der Krebsbehandlung besteht ein dringender Bedarf an einem klinischen Unterstützungstool, das die klinischen Implikationen spezifischer Mutationsereignisse in einem standardisierten und leicht interpretierbaren Format aufbereitet. Zu diesem Zweck haben wir OncoKB entwickelt, eine von Experten geleitete Wissensdatenbank für präzisionsorientierte Onkologie. Methoden OncoKB annotiert die biologischen und onkogenen Effekte sowie die prognostische und prädiktive Bedeutung somatischer molekularer Veränderungen. Potentielle therapeutische Implikationen werden anhand des Evidenzniveaus, das darauf hinweist, dass eine spezifische molekulare Veränderung prädiktiv für die Arzneimittelansprechen ist, gestaffelt. Grundlage hierfür sind die Kennzeichnung durch die US Food and Drug Administration, die Leitlinien des National Comprehensive Cancer Network, empfehlungen krankheitsspezifischer Expertengruppen und wissenschaftliche Literatur. Ergebnisse Bis heute wurden mehr als 3.000 einzigartige Mutationen, Fusionsgene und Kopienzahlanomalien in 418 krebsassoziierten Genen annotiert. Um den Nutzen von OncoKB zu testen, haben wir alle genomischen Ereignisse in 5.983 Primärtumorproben aus 19 Krebsarten annotiert. Einundvierzig Prozent der Proben wiesen mindestens eine potenziell behandelbare Veränderung auf, von denen 7,5 % prädiktiv für einen klinischen Nutzen einer Standardtherapie waren. Die OncoKB-Anmerkungen sind über eine öffentliche Web-Ressource ( http://oncokb.org ) verfügbar und wurden im cBioPortal für Krebsgenomik integriert, um die Interpretation genomischer Veränderungen für Ärzte und Forscher zu erleichtern. Schlussfolgerung OncoKB, eine umfassende und kuratierte Wissensdatenbank für präzisionsorientierte Onkologie, bietet Onkologen detaillierte, evidenzbasierte Informationen zu individuellen somatischen Mutationen und strukturellen Veränderungen in Patiententumoren, mit dem Ziel, optimale Therapieentscheidungen zu unterstützen.