Definição e classificação de unidades de avaliação para previsão de estrutura terciária no CASP12 facilitada por métricas semi‐automatizadas

Para fins de avaliação, os alvos do CASP são divididos em unidades de avaliação. Apresentamos aqui a definição oficial das unidades de avaliação (EUs) do CASP12 e sua classificação em categorias de dificuldade. Cada alvo pode ser avaliado como uma EU (o alvo inteiro) ou/ e várias EUs (domínios estruturais separados ou grupos de domínios estruturais). O cenário específico para uma divisão de alvo é determinado pela organização do domínio dos modelos disponíveis, a diferença no desempenho do servidor em domínios separados em comparação com a combinação dos domínios e a inspeção visual. No final, 71 alvos foram divididos em 96 EUs. A classificação das EUs em categorias de dificuldade foi feita semi-automaticamente com a assistência de métricas fornecidas pelo Centro de Previsão. Essas métricas levam em conta as semelhanças sequenciais e estruturais das EUs com potenciais modelos estruturais do Banco de Dados de Proteínas, e para o desempenho básico das previsões de servidores automatizados. As métricas separam prontamente as 96 EUs em 38 EUs que devem ser diretas para modelagem baseada em modelo (TBM) e 39 que se espera que sejam difíceis para modelagem por homologia e, portanto, são deixadas para modelagem livre (FM). As 19 unidades de avaliação de limite restantes foram chamadas de FM/TBM e foram inspecionadas caso a caso. O artigo também aborda características estruturais e evolutivas de alvos selecionados relevantes ao nosso artigo acompanhante que apresenta a avaliação das previsões de FM e FM/TBM, e aborda características estruturais das unidades de avaliação mais difíceis da categoria FM. Finalmente, sugerimos melhorias para os procedimentos de definição e classificação de EUs.