Análisis del transcriptoma de una sola célula recapitulando las respuestas celulares y de desarrollo a los estresores abióticos en arroz

RESUMEN El metabolismo y la reproducción de las plantas dependen de la división de labores entre las células. Sin embargo, las células con diversas funciones a menudo se estudian en conjunto, donde sus especificidades se diluyen. Aquí, aplicamos la secuenciación de ARN de una sola célula a la parte aérea de plántulas de arroz que crecen en varios ambientes. Capturamos los transcriptomas de miles de células, identificamos todos los tipos celulares principales y reconstruimos sus trayectorias de desarrollo. Encontramos que los estresores abióticos no solo afectan la expresión génica de manera específica del tipo celular, sino que también impactan en el tamaño físico de las células y en la composición de las poblaciones celulares. Validamos algunas de estas conclusiones con microscopía y proporcionamos mecanismos de desarrollo con análisis computacionales. En conjunto, nuestro estudio representa un recurso de datos de referencia del atlas de transcriptoma de una sola célula en arroz y una ilustración de cómo explotar dicho recurso para impulsar descubrimientos en biología vegetal.