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Ensembl Genomes (https://www.ensemblgenomes.org) は、Ensemblプロジェクトによって開発された脊椎動物リソースを補完する非脊椎動物ゲノムと分析へのアクセスを提供します (https://www.ensembl.org)。両方のリソースは、ゲノム配列、注釈、変異、トランスクリプトームデータおよび比較分析を提示する生命の系統にわたる一貫したインターフェースを通じて、ゲノム注釈を総合的に提供します。ここでは、プロジェクト開始以来の植物、後生動物および真菌ゲノムの最大の増加を呈示し、世界で最も包括的なゲノムリソースの一つを創出したことを報告します。また、我々はBacteriaポータルにおけるゲノム冗長性の削減に対する取り組みを説明します。遺伝子注釈における新しい取り組み、パングノーム分析への新たなサポート、Ensembl Rapid Releaseリソースを通じたデータの普及を加速させるための努力、そして新しいAlphaFoldビジュアライゼーションについて詳しく述べます。最後に、Ensemblとの統合に関する更新や微生物研究コミュニティへのサポートを改善する計画を含む今後の計画の詳細を提示します。ソフトウェアとデータは、ウェブサイト、オンラインツールプラットフォーム、プログラムによるインターフェースを通じて制限なく提供されます(Apache 2.0ライセンスの下)。データの更新はEnsemblのリリースサイクルと同期しています。
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Andrew Yates
European Bioinformatics Institute
James E. Allen
University of Manchester
Ridwan Amode
Nucleic Acids Research
Oregon State University
Wellcome Sanger Institute
Cold Spring Harbor Laboratory
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Yates et al. (水曜日) はこの問題を研究しました。
synapsesocial.com/papers/69ffe24a831589f3542dadbe — DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkab1007