고도로 이형접합인 '텍사스' 아몬드의 단계적 유전체가 이형접합 구조 변이에 연결된 대립유전자 특이적 발현 패턴을 밝혀냅니다.

초록 전통 아몬드 품종의 대다수는 자가 불화합성이며, 종의 변이 수준이 매우 높아 높은 이형접합 유전체를 초래합니다. 따라서 다양한 하플로타입에 대한 정보는 이 종의 형질 변이의 유전적 기초를 이해하는 데 특히 관련이 있습니다. 그러나 여러 아몬드 품종에 대한 참조 유전체가 존재하지만, 그 중 어느 것도 단계적이지 않으며 하플로타입 수준의 유전체 정보를 가지고 있지 않습니다. 여기서는 아몬드 cv. 텍사스의 유전체를 단계적으로 조립한 결과를 제시합니다. 이 새로운 조립체는 이전 버전의 텍사스 유전체보다 13% 더 많은 조립된 서열을 가지고 있으며, 특히 중심체와 같은 반복 영역에서 연속성이 증가했습니다. 우리의 분석 결과 '텍사스' 유전체는 SNP, 짧은 인델, 구조 변이 수준에서 높은 이형접합도를 가지고 있음을 보여줍니다. 많은 SV는 이형접합 전이 요소 삽입의 결과이며, 많은 경우 유전자 서열도 포함합니다. 이러한 유전적 변이의 결과가 유전자의 존재/부재에 미치는 직접적인 영향 외에도, 우리의 결과는 유전자 근처에 위치한 변이가 종종 대립유전자 특이적 유전자 발현과 연관되어 있음을 보여주며, 이는 아몬드에서 이형접합 SV의 중요성을 강조합니다.