전장 유전체 서열 분석과 다중 디지털 PCR을 결합한 새로운 초고감도 종양 정보 기반 구조 변이 접근 방식을 사용하여 초기 유방암에서 ctDNA 역학 모니터링.

568 배경: 초기 유방암(EBC)의 신보조 치료 중 지속적인 순환 세포 프리 종양 DNA(ctDNA) 검출은 고위험 질병을 나타냅니다. EBC 절제 후 ctDNA 검출(분자 잔여 질병, MRD)은 잠재적인 전이성 질병과 임박한 질병 재발을 나타냅니다. EBC 관리에 ctDNA를 통합하기 위해서는 접근 가능하고 확장 가능한 진단 도구가 필요합니다. 여기에서는 구조 변이(SV)에 대한 분석을 바탕으로 ctDNA 평가를 위한 고감도 개인화된 종양 정보 접근 방식을 적용합니다. 방법: 신보조 요법(NAT)에 적합한 EBC 환자 170명이 2014년 12월부터 2019년 3월까지의 전향적 SCAN-B 연구(NCT02306096)를 통해 모집되었습니다(25.8% TNBC, 47.1% HR+/HER2- 및 24.1% HER2+). 최소 품질 기준을 충족한 첫 번째 46명의 연속 환자(567개의 혈장 샘플 포함)에 대한 중간 결과가 제시됩니다(10%의 종양 내용물 및 10배 시퀀스 깊이). 종양 물질에 대한 전장 유전체 서열 분석(WGS)이 수행되었고 ctDNA 분석에 사용할 최소 8개의 SV를 추적하기 위해 개인화된 다중 디지털 PCR 분석이 설계되었습니다. 혈장 샘플은 기준선, NAT 중, 수술 전후 및 추적 관찰 중 6개월 간격으로 수집되었습니다. 임상 특성과 재발 결과가 기록되었습니다. 결과: 모든 유방암 아형에서 46명 중 43명(93%) 환자에서 수술 전 하나 이상의 시점에서 ctDNA가 검출되었으며, 중간 변형 대립유전자의 빈도(VAF)는 0.14%(범위 0.0002% - 27.6%)였습니다. NAT 종료 시 ctDNA 수치가 24%(11/46) 환자에서 여전히 검출되었으며; ctDNA 양성 환자 5/11(45%)가 질병 재발을 경험한 반면 ctDNA 음성 환자는 1/35(3%)였습니다(P=0.002, Fisher의 정확한 검정). 수술 후 하나 이상의 시점에서 ctDNA가 임상 재발을 경험한 6/6명(100%) 환자에서 검출되었으며, 이들은 최대 52개월의 리드 타임을 보였고(중간 11.8개월, 범위 3.5~52개월). 지금까지 임상 재발이 나타나지 않은 40명의 환자에서 수술 후 수집된 287개의 혈장 시점 중 285곳(99.3%)에서 ctDNA가 검출되지 않았습니다. 수술 후 ctDNA 검출은 ctDNA가 없는 경우에 비해 전반적인 생존율(OS)이 좋지 않은 것으로 나타났습니다(log-rank P<0.0001). 결론: 신보조 요법을 받는 EBC 환자에 대한 진행 중인 전향적 연구의 중간 분석에서, 우리는 환자 특정 SV를 추적하는 새로운 종양 정보 디지털 PCR 분석을 사용하여 ctDNA를 분석했습니다. 신보조 요법 후 수술 전 ctDNA 검출은 질병 재발의 고위험과 연관이 있었습니다. 임상 재발이 있는 환자에서 수술 후 ctDNA 검출이 100% 관찰되었으며, 이는 poorer OS 및 긴 리드 타임과 관련이 있었습니다. 우리의 데이터는 SV가 MRD 분석물로서의 가능성을 입증하며, EBC에서 이 접근 방식으로 달성할 수 있는 높은 수준의 임상 민감성을 제공하는 증거를 제시합니다. 임상 시험 정보: NCT02306096.