Desenvolvimento e verificação de uma assinatura genética relacionada à lipotoxicidade para prever o prognóstico e o perfil imunológico no câncer colorretal

BACKGROUND: O câncer colorretal (CCR), um tumor letal do intestino, apresenta lipotoxicidade, que exerce uma influência significativa sobre o início e o desenvolvimento de distúrbios intestinais. Este estudo fornece uma avaliação aprofundada dos genes relacionados à lipotoxicidade (LRGs) no contexto do tratamento do CCR. MÉTODOS: Genes diferencialmente expressos (DEGs) dentro do conjunto de dados do Cancer Genome Atlas-CCR e LRGs foram intersecados para obter os LRG-DEGs. Subsequentemente, foram realizadas análises de regressão de Cox univariada e um modelo de floresta de sobrevivência aleatória para selecionar LRGs prognósticos e construir um modelo de risco para pacientes com CCR. Em seguida, o prognóstico foi investigado por meio de análises prognósticas independentes, construção de nomogramas, análises de enriquecimento, análise do microambiente imunológico e testes de sensibilidade a medicamentos. Finalmente, a PCR quantitativa em tempo real (RT-qPCR) foi utilizada para verificar os níveis de expressão dos LRGs prognósticos. RESULTADOS: O modelo de risco construído com cinco LRGs prognósticos (PPARGC1A, CPT2, CXCL1, FABP4 e OFCC1) mostrou alta eficácia prognóstica. O nomograma construído subseqüentemente, com base no escore de risco, idade, estágio T e estágio M, mostrou forte poder prognóstico. Além disso, foi observado o enriquecimento de diversas vias em diferentes grupos de risco, exemplificado pela via de sinalização PPAR e cascatas de complemento e coagulação. A análise do microambiente imunológico revelou a mais forte associação positiva entre FABP4 e células NK. Os testes de sensibilidade a medicamentos identificaram drogas eficazes para pacientes com CCR, como midostaurina e lenalidomida. Notavelmente, a RT-qPCR confirmou níveis elevados de expressão para CXCL1 e OFCC1 e níveis reduzidos para FABP4, PPARGC1A e CPT2 em pacientes com CCR. CONCLUSÃO: Cinco LRGs prognósticos foram determinados para CCR, e um novo modelo de risco foi desenvolvido e validado, revelando o papel crítico dos LRGs no CCR e melhorando nossa compreensão das intervenções clínicas para este tipo de câncer.