O primeiro genoma mitocondrial completo de Zu cristatus (Bonelli, 1819) lança nova luz sobre sua posição filogenética e evolução molecular

Os peixes são componentes-chave da megafauna do fundo do mar, e adaptações evolutivas à vida em águas profundas parecem ter ocorrido de forma independente em pelo menos 22 ordens de peixes. Nesse contexto, a análise de ainda mais genomas e mitogenomas de peixes tem importância fundamental, fornecendo um recurso valioso para entender os mecanismos moleculares que fundamentam a adaptação evolutiva, especialmente a ambientes extremos, como o fundo do mar. Aqui, relatamos o primeiro genoma mitocondrial completo de Zu cristatus (Bonelli, 1819), fornecendo informações essenciais sobre sua estrutura e filogenia. Após sequenciamento na plataforma Illumina HiSeq 4000, processamento e montagem via software MitoFinder v.1.4.1, foi anotada uma única molécula de mtDNA circular de 17.450 pb de comprimento. Um total de 37 genes foram identificados, incluindo a primeira região D-loop para esta espécie. A assimetria tanto para skews de AT quanto para skews de GC é negativa, e o conteúdo de AT é de 56,4%. Também detectamos a presença de 15 pequenas regiões nucleotídicas intergênicas não codificantes (IGN) e alguns códons de parada raros em peixes ósseos. Análises de distância par a par e filogenéticas contra uma lista de outras sequências mitocondriais de 42 peixes ósseos confirmaram a filogenia atual com ordens anteriormente relacionadas. A análise EasycodeML revelou que apenas 4 PCGs passaram por seleção positiva. Novas questões sobre a filogenia dos Lampriformes surgiram de nossas análises filogenéticas do COI de Lampriformes. No geral, os achados deste estudo destacam a necessidade de elucidar as características genéticas dos peixes ósseos em relação à sua adaptação ao fundo do mar, com foco em espécies raras e interessantes.