Resumo A propagação global contínua da influenza aviária altamente patogênica (HPAI) continua a causar grandes impactos na avicultura, vida selvagem e saúde pública. Entre os países mais afetados na Europa, a Itália experimentou três grandes ondas epidêmicas entre 2016 e 2023, causadas pelos subtipos H5N8 e H5N1. No entanto, as dinâmicas de dispersão espaciotemporal subjacentes e os fatores impulsores dessas epidemias ainda precisam ser elucidadores. Aqui, combinamos o sequenciamento do genoma viral com a inferência filogeográfica contínua para reconstruir a história evolutiva e espaciotemporal dessas epidemias. Ao combinar dados genéticos com variáveis de paisagem, variáveis relacionadas à avicultura e abundâncias de aves selvagens, exploramos como o ambiente estava associado à difusão viral no espaço e no tempo. Identificamos padrões de difusão distintos e associações ambientais ao longo das três epidemias. As duas primeiras ondas (2016–2017 e 2021–2022) foram dominadas pela transmissão local de aves para aves em áreas de alta densidade de criação, com áreas agrícolas sendo significativamente associadas a uma velocidade de dispersão da linhagem viral relativamente mais alta em 2021-2022. Em contraste, a onda mais recente (2022-2023) mostrou evidências de eventos de dispersão de média a longa distância positivamente associados a zonas húmidas, corpos d'água e abundâncias de gaivotas, apontando para um papel maior das aves selvagens na dinâmica espacial da HPAI. Os coeficientes de difusão ponderados estimados e as distâncias da frente de onda espacial revelaram uma mudança de uma propagação local impulsionada por aves para uma propagação de longa distância, possivelmente relacionada a aves selvagens. Nossas descobertas destacam uma mudança progressiva de epidemias impulsionadas por aves para dinâmicas de transmissão ambiental mais complexas, envolvendo aves selvagens e habitat natural. Essas mudanças sublinham a necessidade de adaptar estratégias de vigilância e controle a uma paisagem viral em evolução e ecologicamente diversificada.
Fornasiero et al. (Qui,) estudaram esta questão.