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Bibliotecas espectrais de massa são coleções de espectros de referência, geralmente associadas a analitos específicos dos quais os espectros foram gerados, que são usados para análise posterior de novos espectros. Existem muitos formatos diferentes usados para codificar bibliotecas espectrais, mas nenhum passou por um processo de padronização para garantir uma ampla aplicabilidade em várias aplicações. Como parte da Iniciativa de Padrões em Proteômica da Organização de Proteoma Humano (PSI), desenvolvemos um formato padronizado para codificação de bibliotecas espectrais, chamado mzSpecLib (https://psidev.info/mzSpecLib). É principalmente um modelo de dados que codifica flexivelmente metadados sobre as entradas da biblioteca usando o vocabulário controlado extensível PSI-MS, e pode ser codificado e convertido entre diferentes formatos de serialização. Também desenvolvemos um modelo de dados padronizado e serialização para anotações de picos de íons fragmento, chamado mzPAF (https://psidev.info/mzPAF). Está definido como um padrão separado, uma vez que pode ser usado para outras aplicações além das bibliotecas espectrais. Os padrões mzSpecLib e mzPAF são compatíveis com os padrões PSI existentes, como ProForma 2.0 e o Identificador Universal de Espectro. Os padrões mzSpecLib e mzPAF foram definidos principalmente para peptídeos em aplicações de proteômica, com suporte básico para pequenas moléculas. Eles poderiam ser estendidos no futuro para outros campos que precisam codificar bibliotecas espectrais para analitos não peptídicos.
Klein et al. (Mon,) estudaram esta questão.