Genes associados à senescência celular como marcadores diagnósticos de transtorno depressivo maior e suas correlações com infiltração imune

Contexto Evidências emergentes ligam a senescência celular à patogênese do transtorno depressivo maior (TDM), uma doença mental debilitante e que ameaça a vida. No entanto, os papéis dos genes relacionados à senescência celular no TDM são em grande parte desconhecidos e foram investigados neste estudo utilizando uma análise abrangente. Métodos Dados de sequenciamento de microarranjo de sangue periférico foram baixados do banco de dados Gene Expression Omnibus (GEO) e os genes relacionados à senescência celular foram recuperados do banco de dados CellAge. Uma análise de rede de co-expressão gênica ponderada foi utilizada para filtrar genes associados ao TDM. Interações proteína-proteína (PPI) foram previstas com base nos dados do STRING, e quatro algoritmos topológicos foram usados para identificar genes centrais da rede PPI. A infiltração imune foi avaliada utilizando o CIBERSORT, seguida de uma análise de correlação entre genes centrais e células imunes. Resultados Um total de 84 genes relacionados à senescência celular foram expressos diferencialmente em pacientes com TDM em comparação com participantes controle saudáveis. Entre os 84 genes, 20 foram identificados como associados ao fenótipo da doença TDM, e esses genes estavam principalmente envolvidos em vias de sinalização relacionadas a hormônios (como estrogênio, hormônio esteroide e corticosteroide) e em vias imunes e inflamatórias. Três genes, a saber, JUN, CTSD e CALR, que apresentaram downregulação no TDM, foram identificados como os genes centrais. A expressão dos genes centrais correlacionou-se moderadamente com múltiplas células imunes, como Tregs, células NK e células T CD4+, e a abundância dessas células imunes diferiu marcadamente em amostras de TDM. Múltiplos microRNAs, fatores de transcrição e drogas de pequenas moléculas direcionadas aos genes centrais foram previstas para explorar seus mecanismos regulatórios moleculares e seu potencial valor terapêutico no TDM. Conclusão JUN, CTSD e CALR foram identificados como potenciais marcadores diagnósticos do TDM e podem estar envolvidos no mecanismo imunoinflamatório do TDM.