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Este protocolo extrai DNA genômico de amostras de zooplâncton em massa, preservadas em etanol ou congeladas - utilizando extração de Fenol/Cloroformio. O protocolo foi desenvolvido para ser o mais semelhante possível ao protocolo padrão usado para DNA ambiental no Programa de Observação Oceanográfica do Hakai Institute, para ser utilizado em metagenômica de DNA a jusante:
Novotny et al. (Qui,) estudaram esta questão.