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Resumo As modificações de RNA são essenciais para o estabelecimento da identidade celular. Embora evidências crescentes indiquem que as modificações de RNA regulam a resposta imune inata, seu papel na diferenciação e polarização de monócitos para macrófagos não está claro. Enquanto o m 6 A foi amplamente estudado, outras modificações de RNA, incluindo 5 hmC, permanecem mal caracterizadas. Nós avaliamos os epitranscriptomas, transcriptomas, translatomas e proteomas de monócitos e macrófagos em repouso e em estados pró e anti-inflamatórios. O mapeamento em todo o transcriptoma de m 6 A e 5 hmC revela enriquecimento de m 6 A e/ou 5 hmC em categorias específicas de transcritos essenciais para a diferenciação de macrófagos. Nossas análises indicam que as modificações m 6 A e 5 hmC estão presentes em transcritos com funções críticas em macrófagos pró e anti-inflamatórios. Notavelmente, também descobrimos a coocorrência de m 6 A e 5 hmC em isoformas alternadamente spliceadas e/ou extremidades opostas das regiões não traduzidas (UTR) de mRNAs com papéis chave na biologia de macrófagos. Em exemplos específicos, o RNA 5 hmC controla a degradação de transcritos independentemente de m 6 A. Este estudo fornece (i) um conjunto de dados abrangente para investigar o papel das modificações de RNA em um sistema plástico (ii) um recurso para explorar diferentes camadas de regulação da expressão gênica no contexto da diferenciação e polarização de monócitos para macrófagos humanos, (iii) novas percepções sobre as modificações de RNA como reguladores centrais de células efetoras na imunidade inata.
Pinello et al. (Qui,) estudaram essa questão.