Paisagem Genômica do Adenocarcinoma de Próstata em Estágio Inicial em Pacientes Mexicanos: Um estudo exploratório

Resumo Contexto Desigualdades na saúde foram destacadas entre pacientes com adenocarcinoma de próstata (PRAD) devido à etnia. Homens mexicanos apresentam uma doença mais agressiva do que outros pacientes, resultando em desfechos de tratamento menos favoráveis. O objetivo foi identificar a paisagem mutacional que poderia ajudar a reduzir as desigualdades de saúde entre grupos minoritários e gerar o primeiro estudo exploratório em genômica de PRAD em pacientes mexicanos. Métodos Tecidos tumorais fixados em formol e embebidos em parafina de 20 pacientes mexicanos com PRAD em estágio inicial tratados no Instituto Nacional de Cancerología, Cidade do México, de 2017 a 2019 foram analisados. O DNA tumoral foi preparado para sequenciamento de exoma completo, e os arquivos resultantes foram mapearados contra h19 usando BWA-MEM. Os pacotes Strelka2 e Lancet foram usados para identificar variantes de nucleotídeo único (SNV) e inserções ou deleções. O FACETS foi usado para determinar alterações no número de cópias somáticas (SCNA). A interface web do Cancer Genome Interpreter foi utilizada para determinar a relevância clínica das variantes. Resultados Os pacientes estavam em um estágio clínico inicial e apresentavam uma idade média de 59,55 anos (desvio padrão DP: 7,1 anos), com 90% deles tendo um escore de Gleason de 7. O tempo de acompanhamento foi de 48,50 meses (DP: 32,77), com recidivas e progressão em 30% e 15% dos pacientes, respectivamente. NUP98 (20%), CSMD3 (15%) e FAT1 (15%) foram os genes mais frequentemente afetados por SNV; ARAF (75%) e ZNF419 (70%) foram os mais frequentemente afetados por perdas e ganhos de cópias somáticas. Um quarto dos pacientes tinha mutações úteis como biomarcadores para o uso de inibidores de PARP, incluindo mutações em BRCA, RAD54L e ATM. SBS05, DBS03 e ID08 foram as assinaturas mutacionais mais comuns presentes nesta coorte. Nenhuma associação com recidiva ou progressão foi identificada. Conclusões Este estudo revela a paisagem mutacional do adenocarcinoma de próstata em estágio inicial em homens. Compreender os padrões mutacionais e as mutações acionáveis no câncer de próstata inicial pode informar abordagens de tratamento personalizadas e reduzir a sub-representação em estudos genômicos de câncer.