Identificação de ALYREF em câncer pan como um novo biomarcador prognóstico do câncer e potencial mecanismo regulatório no câncer gástrico

ALYREF é considerado uma proteína específica de ligação m5C de mRNA que reconhece locais m5C no RNA e facilita a exportação de RNA do núcleo para o citoplasma. Expresso em vários tecidos e altamente envolvido na regulação transcricional, ALYREF tem o potencial de se tornar um novo marcador diagnóstico e alvo terapêutico para pacientes com câncer. No entanto, poucos estudos focaram em sua função durante a carcinogênese e progresso. Para explorar o papel de ALYREF na tumorigenese, foram utilizados os bancos de dados TCGA e GTEx para investigar a relação de ALYREF com câncer pan. Descobrimos que ALYREF estava altamente expresso na maioria dos tipos de câncer e que níveis de expressão elevados estavam positivamente associados a pior prognóstico em muitos cânceres. A análise de GO e KEGG mostrou que ALYREF é essencial na regulação do ciclo celular e da reparação de erros gênicos na progressão tumoral. A análise de correlação da heterogeneidade tumoral indicou que ALYREF poderia estar especialmente correlacionado com a stemness tumoral no adenocarcinoma gástrico (STAD). Além disso, investigamos a função potencial de ALYREF na carcinogênese gástrica. A análise prognóstica de diferentes subtipos moleculares de câncer gástrico (GC) revelou que a alta expressão de ALYREF leva a um pior prognóstico em certos subtipos de GC. Por fim, a análise de enriquecimento revelou que os genes relacionados a ALYREF possuem a função de regular o ciclo celular e a apoptose, que causam influências adicionais na progressão tumoral de GC. Para verificação adicional, reduzimos a expressão de ALYREF por siRNA na linha celular de GC AGS. A redução de ALYREF contribuiu distintamente para a inibição da proliferação celular de GC. Além disso, observou-se que a redução de ALYREF induziu células AGS a pararem na fase G1 e aumentou a apoptose celular. Nossas descobertas destacaram a função essencial de ALYREF na tumorigenese e revelaram a contribuição específica de ALYREF para a carcinogênese gástrica através da análise pan-câncer e experimentos biológicos.