Aproveitando o Sequenciamento de Nova Geração como um Teste de Triagem de Segundo Nível Oportuno e Preciso para a Triagem Neonatal de Erros Inatos do Metabolismo

Neste estudo, avaliamos a implementação de um teste de triagem genética de segundo nível usando um painel de sequenciamento de nova geração (NGS) baseado em amplicon em nosso laboratório durante o período de 1 de setembro de 2021 a 31 de agosto de 2022 para a triagem neonatal (NBS) de seis condições para erros inatos do metabolismo: citrulinemia tipo II (MIM #605814), deficiência primária sistêmica de carnitina (MIM #212140), acidemia glutarica tipo I (MIM #231670), deficiência de beta-ceto-tioloase (#203750), deficiência de holocarboxilase sintase (MIM #253270) e deficiência de 3-hidroxi-3-metilglutiril-CoA liase (MIM #246450). O painel de NGS projetado sob medida pode detectar variantes de sequência nos genes relevantes e também rastrear especificamente a presença da variante hotspot IVS16ins3kb de SLC25A13 pelo algoritmo de chamada de variante de número de cópia. Testes genéticos de segundo nível foram realizados para 1,8% de um total de 22.883 amostras de NBS. A taxa de falso positivo para essas seis condições após o teste de segundo nível de NGS foi de apenas 0,017%, e dois casos de citrulinemia tipo II teriam sido perdidos como falsos negativos se apenas testes bioquímicos de primeiro nível tivessem sido realizados. Os casos verdadeiros positivos confirmados foram citrulinemia tipo II (n = 2) e deficiência primária sistêmica de carnitina (n = 1). Os falsos positivos foram posteriormente confirmados como portadores de citrulinemia tipo II (n = 2), portador de acidemia glutarica tipo I (n = 1) e portador de deficiência primária sistêmica de carnitina (n = 1). Não foram relatados falsos negativos. A incorporação de um teste de triagem genética de segundo nível por NGS melhorou muito o desempenho do nosso programa, mantendo o prazo de 5 dias úteis, como antes. Além disso, informações genéticas precoces estão disponíveis no momento da convocação para facilitar uma melhor gestão clínica e aconselhamento genético.