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Este protocolo descreve a extração automatizada e SPRI de DNA HMW a partir de amostras de pequenos artrópodes destinadas ao sequenciamento de leituras longas, utilizando o kit de extração de DNA HMW da Qiagen MagAttract e o Thermo Fisher KingFisher™ Apex. Este protocolo é principalmente eficaz para a classe Arachnida e a ordem Isopoda dentro do phylum Arthropoda coberto pelo Programa Árvore da Vida. Este protocolo resultou em extrações bem-sucedidas para várias espécies, incluindo Linyphia triangularis, Anilocra frontalis, Lekanesphaera levii, Cymodoce truncata, Porcellio scaber, Idotea baltica e Ligia oceanica, além da geração de um genoma de referência para Troglohyphantes excavatus. O resultado deste protocolo é DNA HMW, que, dependendo do rendimento e do tamanho do genoma da espécie, pode ser direcionado para Pooling de DNA HMW, Fragmentação de DNA HMW: Diagenode Megaruptor®3 para LI PacBio ou Fragmentação de DNA HMW: g-Tube para ULI PacBio. Este protocolo foi adaptado principalmente do protocolo 'Extração de DNA HMW de Aranhas Saltadoras v.4'; este foi desenvolvido através de P&D pelo grupo Meier/Jiggin para tecido de aranha saltadora, que utiliza elementos do protocolo Qiagen MagAttract e da extração do Lawniczak Lab v.6 para pequenos insetos. Este protocolo também incorpora o elemento de SPRI pré-corte do protocolo 'Extração de DNA HMW da Árvore da Vida Sanger: MagAttract Automatizado v.2'. Siglas HMW: peso molecular alto SPRI: imobilização reversível em fase sólida LI: entrada baixa ULI: entrada ultra-baixa.
Denton et al. (Mon,) estudaram esta questão.