Sequenciamento de Célula Única 10x Chromium 5’ VDJ v1

A técnica de sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-Seq) obtém perfis de expressão gênica de células individuais para análise, ao contrário de comparar os sinais de expressão gênica médios entre amostras de células em massa. A capacidade de examinar mudanças transicionais entre células individuais em alta resolução define de maneira única populações celulares raras, identifica a heterogeneidade dentro de populações celulares, investiga a dinâmica das populações celulares em profundidade ao longo do tempo e até mesmo interroga as vias de sinalização celular. O sequenciamento scRNA permite a exploração da heterogeneidade celular a partir dos diversos tecidos de biospecimens; tumor, amostras de biópsia e células organoides. Para perfilar o repertório imunológico das células, transcritos de receptores de células T (TCR) e/ou receptores de células B (BCR) de comprimento total (5’ UTR até a região constante) de 500-10.000 células individuais por amostra podem ser avaliados. Um total de aproximadamente 750.000 códigos de barras é amostrado separadamente para indexar o transcriptoma e a especificidade do antígeno de cada célula. Isso é feito ao particionar milhares de células em microesferas em emulsão (GEMs) em escala de nanolitros, onde todo o cDNA gerado compartilha um código de barras comum de 10x. Bibliotecas são geradas e sequenciadas, e os códigos de barras de 10x são usados para associar leituras individuais de volta às partições individuais.