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A análise funcional de grandes listas de genes, derivadas na maioria dos casos de abordagens emergentes de genômica, proteômica e varredura em bioinformática em alta produtividade, continua sendo uma tarefa desafiadora e difícil. A análise de enriquecimento de anotação gênica é uma estratégia promissora em alta produtividade que aumenta a probabilidade de os pesquisadores identificar processos biológicos mais pertinentes ao seu estudo. Aproximadamente 68 ferramentas de enriquecimento em bioinformática atualmente disponíveis na comunidade são coletadas nesta pesquisa. As ferramentas são categoricamente agrupadas em três classes principais, de acordo com seus algoritmos de enriquecimento subjacentes. As coleções abrangentes, as classificações únicas de ferramentas e as questões/problemas associados fornecerão uma visão mais abrangente e atualizada sobre as vantagens, armadilhas e tendências recentes em um nível de classificação de ferramentas mais simples, em vez de uma abordagem ferramenta por ferramenta. Assim, a pesquisa ajudará designers/desenvolvedores de ferramentas e usuários finais experientes a entender os algoritmos subjacentes e os detalhes pertinentes de categorias/ferramentas específicas, permitindo que façam as melhores escolhas para seus interesses de pesquisa específicos.
Huang et al. (Ter,) estudaram essa questão.