Nanopartículas de Polímero Molecularmente Impressas para Proteômica de Superfícies de Células de Câncer de Pulmão

A identificação e o direcionamento de proteínas na superfície de células de câncer de pulmão são importantes para o desenvolvimento de medicamentos. As nanopartículas de polímero molecularmente impressas (nanoMIPs) oferecem uma abordagem sintética para o reconhecimento de proteínas nas superfícies celulares. Este trabalho descreve o uso de uma nova abordagem de ‘impressão instantânea’ para caracterizar as diferenças nos proteomas de superfície celular das linhagens de células de câncer de pulmão (A549, H460, H522) e uma linha celular não cancerosa (BEAS-2B) para potenciais alvos proteicos em aplicações diagnósticas e terapêuticas. A proteômica quantitativa baseada em espectrometria de massas identificou 2381 proteínas. Limites de mudança de dobramento e valor de p foram usados para definir proteínas diferencialmente expressas (DEPs) que são estatisticamente e biologicamente significativas entre as linhagens celulares, resultando em 353, 426 e 274 DEPs para A549, H460 e H522, respectivamente, quando comparadas à BEAS-2B. As DEPs identificadas em comparações de linhagens celulares sobrepostas foram analisadas usando enriquecimento de Gene Ontology e uma rede de interação proteína-proteína para identificar proteínas hub. Entre essas proteínas hub, cinco proteínas (NPM1, TOP2A, EZH2, PRKDC e HNRNPK) foram identificadas como clinicamente relevantes quando referenciadas no banco de dados Human Protein Atlas e na literatura, destacando seu potencial como alvos diagnósticos e terapêuticos. Esses achados destacam o potencial da impressão instantânea baseada em nanoMIP como uma alternativa às abordagens ‘clássicas’ para identificar potenciais alvos proteicos para aplicações diagnósticas e terapêuticas.