CPC2: um calculador de potencial de codificação rápido e preciso baseado em características intrínsecas da sequência

Com os avanços nas tecnologias de sequenciamento de próxima geração, numerosos novos transcritos em um grande número de organismos foram identificados. Com o objetivo de uma avaliação rápida e precisa da capacidade de codificação de transcritos de RNA, atualizamos o calculador de potencial de codificação CPC1 para CPC2. CPC2 executa ∼1000 vezes mais rápido que o CPC1 e apresenta melhor precisão em comparação com o CPC1, especialmente para transcritos longos não codificantes. Além disso, o modelo do CPC2 é neutro em relação às espécies, tornando-o viável para transcriptomas de organismos não modelo em constante crescimento. Um servidor web amigável para dispositivos móveis, bem como um pacote independente para download, está disponível gratuitamente em http://cpc2.cbi.pku.edu.cn.