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A integração de conjuntos de dados de transcriptoma de célula única e acessibilidade à cromatina permite uma compreensão mais profunda da heterogeneidade celular. Realizamos sequenciamento de ATAC de núcleo único (snATAC-seq) e RNA (snRNA-seq) para gerar perfis de acessibilidade à cromatina e transcrição específicos de tipo celular do rim humano adulto. Demonstramos que o snATAC-seq é comparável ao snRNA-seq na atribuição de identidade celular e pode refinar ainda mais nossa compreensão da heterogeneidade funcional no néfron. A maioria das regiões de cromatina diferencialmente acessíveis está localizada em promotores e uma proporção significativa está intimamente associada a genes diferencialmente expressos. O enriquecimento específico de tipo celular de motivos de ligação de fatores de transcrição implica na ativação de NF-κB que promove a expressão de VCAM1 e impulsiona a transição entre uma subpopulação de células epiteliais do túbulo proximal. Nossa abordagem multi-ômica melhora a capacidade de detectar estados celulares únicos dentro do rim e redefine a heterogeneidade celular no túbulo proximal e na alça ascendente espessa.
Muto et al. (Terça,) estudaram essa questão.