A trombomodulina é encontrada no endotélio de artérias, veias, capilares e linfáticos, e no sinciciotrofoblasto da placenta humana.

Utilizamos anticorpos contra trombomodulina humana isolada da placenta para investigar a distribuição deste cofator para a ativação da proteína C nos tecidos humanos. A trombomodulina foi encontrada em células endoteliais de artérias, veias, capilares e linfáticos por coloração imuno-citoquímica utilizando um método de peroxidase de avidina-biotina. A trombomodulina não foi detectada nas células de revestimento sinusoidal do fígado ou nas vênulas endoteliais de alto endotélio pós-capilares do linfonodo, embora estas últimas contenham um outro antígeno endotelial, o fator von Willebrand. Outras células observadas contendo antígeno da trombomodulina são as do sinciciotrofoblasto na placenta. A trombomodulina no sinciciotrofoblasto estava primariamente na superfície da membrana plasmática que forma o seio sanguíneo materno. O sinciciotrofoblasto também foi corado com anticorpos contra o fator von Willebrand, o que implica que essas células têm múltiplas funções endoteliais. O antígeno da trombomodulina foi encontrado em todos os órgãos estudados, com a notável exceção do cérebro.