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As serina-integrases codificadas por bacteriófagos são membros da grande família de serina-recombinases e catalisam recombinação integrativa específica de sítio entre um local attP do fago e um local attB da bactéria para formar um profago integrado. A excisão do profago envolve um segundo evento de recombinação específica de sítio, no qual os sítios gerados pela integração, attL e attR, são usados como substratos para regenerar attP e attB. A excisão é catalisada pela integrase, mas também requer um fator de direcionalidade de recombinação (RDF) codificado por fago. Os locais de recombinação Bxb1, attP e attB, são pequenos (<50 bp), diferentes em sequência e quase simétricos, e dão origem a produtos recombinantes attL e attR que são assimétricos, mas semelhantes entre si, cada um composto de metades do tipo B e P. Mostramos aqui que a determinação dos produtos corretos de excisão é um processo em duas etapas, com uma etapa presináptica dependente de RDF que alinha attL e attR na orientação correta e uma etapa pós-sináptica na qual o dinucleotídeo central não palindrômico confere identidade a attL e attR e impede que cada um recombine consigo mesmo.
Ghosh et al. (Terç,) estudaram essa questão.