Banco de Dados de Proteínas: o único arquivo global para dados de estrutura macromolecular 3D

O Banco de Dados de Proteínas (PDB) é o único arquivo global de dados de estrutura tridimensional (3D) de macromoléculas biológicas determinados experimentalmente. Desde 2003, o PDB é gerenciado pelo Worldwide Protein Data Bank (wwPDB; wwpdb.org), um consórcio internacional que supervisiona colaborativamente a deposição, validação, biocuração e disseminação de acesso aberto de dados de estrutura macromolecular 3D. O Arquivo Central do PDB abriga coordenadas atômicas 3D de mais de 144.000 modelos estruturais de proteínas, DNA/RNA e seus complexos com metais e pequenas moléculas e dados experimentais e metadados relacionados. Dados de estrutura e dados/metadados experimentais também são armazenados no Arquivo Central do PDB usando o formato de dados mestre extensível wwPDB PDBx/mmCIF, que continuará a evoluir à medida que dados/metadados de novas técnicas experimentais e métodos de determinação de estruturas sejam incorporados pelo wwPDB. Os impactos do recentemente desenvolvido sistema universal de deposição/validação/biocuração wwPDB OneDep e várias Forças-Tarefa de Validação específicas de métodos do wwPDB no aprimoramento da qualidade das estruturas e dados contidos no Arquivo Central do PDB são descritos junto com os desafios atuais e planos futuros.