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Relatamos a estrutura cristalina de alta resolução (1,9 Å) da oligomicina ligada ao anel da subunidade c(10) da ATP sintase mitocondrial de levedura. A oligomicina se liga à superfície do anel c(10) fazendo contato com duas moléculas vizinhas em uma posição que explica o efeito inibitório na síntese de ATP. A cadeia lateral carboxila de Glu59, que é essencial para a translocação de prótons, forma uma ligação de hidrogênio com a oligomicina através de uma molécula de água que faz a ponte, mas de outra forma está protegida do ambiente aquoso. Os contatos restantes entre a oligomicina e a subunidade c são principalmente hidrofóbicos. Os resíduos de aminoácidos que formam o local de ligação da oligomicina são 100% conservados entre humanos e leveduras, mas são amplamente diferentes dos que estão nos homólogos bacterianos, explicando assim a sensibilidade diferencial à oligomicina. Estudos genéticos anteriores sugerem que o local de ligação da oligomicina se sobrepõe ao local de ligação de outros antibióticos, incluindo aqueles eficazes contra Mycobacterium tuberculosis, e assim emoldura um "local comum de ligação a fármacos." Antecipamos que esse local de ligação a fármacos servirá como um alvo eficaz para novos antibióticos desenvolvidos por design racional.
Symerský et al. (Mon,) estudaram essa questão.